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关于北京新发地市场聚集性疫情，如今科学家已经对病毒源头做出了重要猜想。

10月23日，清华大学、北京市疾病预防控制中心、中国医学科学院病原生物学研究所、北京大学、中国科学院北京基因组研究所联合在《国家科学评论》发文，通过分析相关病例、环境与食品等样品的核酸测序和病毒基因组序列，结合全面的流行病学调查和大数据分析，研究人员揭示，该疫情中病毒源头极有可能是境外疫情高发区的冷链进口食品，并提出，冷链运输或为新冠病毒传播新途径。

研究团队利用自主开发的低病毒载量样品处理方法，对110个病例和环境样本进行了高通量核酸测序，共获得了72条高质量的新冠病毒基因组序列。

病毒基因组序列分析表明，其病毒序列具有明显的突变特征，和我国之前所发现的本土及输入病例均不相同，揭示该次疫情应为单一性的境外输入。

此前重庆医科大学研究人员进行的一项研究则表明，海外传播的经过突变的新毒株可能让中国新冠康复者的抵抗力失效。美国斯克里普斯研究所发布的一项研究显示，在美国、英国和意大利造成大量死亡的D614G突变毒株，其传染性几乎比原始毒株高10倍。